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第三,2019-nCoV中的插入片段1和2与某些HIV-1gp120分离株中的V4和V5区域具有相同的6个氨基酸基序,它们在结构上相互接近,由LEloop将二者分隔开(如图1C所示)[9]。然而,位于2019-nCoV插入片段1和2之间的插入片段3的序列与HIV-1gp120的V1区域相似(存在氨基酸的缺失)。V1区域位于gp120蛋白序列的另一侧,离V4和V5区域较远,因此它不可能与gp120(图1C)中的V4/V5区域具有相互作用。但是在2019-nCoV刺突蛋白的结构模型中,V1区域恰恰位于V4和V5之间[10]。插入片段4被发现与HIV-1的Gag蛋白上区域相同,但这一蛋白与病毒的入侵无关。另外,这个插入位点与其它几个位点相距太远,无法与2019-nCoV刺突蛋白中的其他三个插入片段形成同一个的结构单元(如图1C所示)。因此,综上所述,虽然预印本的作者指出2019-nCoV从HIV-1中获得一些结构上看似不相干的部分进而产生了一个独特的蛋白结构,该结构有利于增强刺突蛋白与受体的结合能力,但是我们并不认为这种结构有任何选择优势或理论根据[8]。

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